Twórca Gentoo, Daniel Robbins, zaczął swoją przygodę z Linuksem od chwili dystrybucji Debian GNU/Linux. Napisał w tym miejscu nieco aplikacji i zapoznał się z tajnikami Linuksa. Jak niepodobna użytkowników tego systemu, wypróbował wciąż parę dystrybucji, wreszcie postanowił odciążyć w rozwoju Stampede Linux. Szybko stał się jej deweloperem i zajmował się w niej systemem zarządzania pakietami. Po jakimś czasie zdecydował się wykreować własną dystrybucję.
Tak narodził się Enoch. Miała owo znajdować się rozprowadzanie szybka, umożliwiająca automatyczne robienie pakietów i proces uaktualniania systemu. Do Daniela zaczęli przyłączać się inni deweloperzy i wkrótce ponad projektem pracowało uprzednio 10 osób. W trakcie rozwoju Enocha stwierdzono, iż wypada przeistoczyć jego nazwę na Gentoo Linux. Około wersji 1.0 Daniel kupił odmienny narzędzia komputerowy, kto jednakże powodował zawieszanie się Linuksa, wskroś co progres dystrybucji zatrzymał się.
Daniel zaczął traktować FreeBSD. Spodobał mu się ów szyk a w szczególności jego maszyneria portów. Gdy wrócił aż do Linuksa, z pomocą innych deweloperów zaczął od nowa rozkręcać Gentoo. System pakietów został zaprojektowany na nowo, nazwano go Portage. Dystrybucja zaczęła rozkręcać się jeszcze szybciej za sprawą ochotnikom, którzy przysyłali poprawki i pomagali zatrzymać pojętny stopień stabilności i bezpieczeństwa.
Zmienił się makieta rozwoju Gentoo, wydzielono odrębne projekty. Regularne spotkania ich liderów utrzymują śmigły stopień rozwoju i współpracy. Powstała Fundacja Gentoo, która zajmuje się sprawami finansowymi i prawnymi także nadzoruje progresja dystrybucji.
W kwietniu 2004 roku matka chrzestna dystrybucji zdecydował się opuścić ze swoich obowiązków dewelopera Gentoo, oraz wewnątrz maju 2005 zatrudnił się wewnątrz Microsoft wewnątrz ramach edukacji firmy co aż do metod rozwoju także testowania projektów FLOSS, przekazując równolegle wszystkie prawa (m.in. aż do ebuildów także aż do logo) niedochodowej Fundacji Gentoo. Dystrybucja rozwija się przecież nadal, nieustannie dodawane są nowe projekty, przyłączają się kolejni deweloperzy, tworzone są nowe pakiety.
Obecnie Robbins negacja logiczna pracuje uprzednio na rzecz firmy Microsoft. Zrezygnował po naokoło pół roku, ponieważ jego zdaniem zakład pracy negacja logiczna dawała odpowiednich perspektyw rozwoju.